日本花柏葉片背面(一)

日本花柏葉片正面(二)

台灣黃檜葉片背面(三)

台灣黃檜葉片正面(四)

扁柏是台灣過去伐木時期貴重且最受歡迎的木材，台灣扁柏、羅生扁柏、日本扁柏形成另一個分支群，經由扁柏葉綠體DNA定序與遺傳變異及族群分化，支持扁柏發源於北美的假說，扁柏的遷移路徑可能由日本群島近距離遷移至台灣，因為扁柏木材香氣濃、樹幹筆直且不易空心，生長在山稜的頂部位置，過去所受到的砍伐比紅檜木更為嚴重，台灣扁柏的分布高度通常略比紅檜木高，生長的地域比紅檜木潮濕，且其生長的植被土壤發育較好。台灣的棲蘭山區是目前世界上面積最大的扁柏林。

葉呈綠色厚而交互對生(葉端圓形)，葉背有明顯白臘，小枝多，枝條是扁平形，故稱為扁柏，終年翠綠。樹幹通直，樹形為圓錐形(側枝由樹幹直角分歧，似男性陽剛強壯的感覺)，樹皮鱗葉先端尖銳，毬果橢圓形。

如上圖(一)與圖(三)比較，其中白色的氣孔帶分部的形狀差異極大，圖(一)的標本來自於苗栗南庄的某一苗圃，正名日本花柏，圖(三)的標本來自於嘉義大學。

日本花柏（Chamaecyparis pisifera (Sieb. et Zucc.) Endl.），柏科扁柏屬常綠大喬木。與紅檜（Chamaecyparis formosensis Matsum.）為近緣種。常見的變種有絨柏（cv.Squarrosa）。

常綠大喬木，高可達50米，樹冠圓錐形，小枝平展而略下垂。中性樹種，較耐蔭，喜溫暖濕潤氣候及深厚的沙壤土，耐寒性及防風性較差。樹皮赤褐色，稍光滑。大枝水平開展，小枝扁平，排成一平面，鱗葉疊瓦狀密生，先端鈍，葉面暗綠色，葉背有白色線紋，微被白粉。雌雄同株，球花單生枝端，7～8月開花，10～11月果熟。鱗片葉先端銳形，與紅檜相似，惟毬果球形，每毬果果鱗8~10。種子三角狀卵形，兩側有寬翅。