第三種製備法是液態菌絲體植菌法。這個技術是由液態醱酵技術演變而來，方法是將牛樟芝菌絲在液態醱酵槽中培養七到十天，以形成一顆一顆小小的菌絲球，然後將含菌絲球的醱酵液接種到段木上。液態菌種接種最大的好處是可以大量接菌，甚至整塊段木都可浸在含菌的醱酵液中，由於培養液中仍殘留豐富的營養物，所以初期菌絲球可利用這些培養基繼續成長，一般在一星期後即可看到白白的菌絲如地毯般覆蓋在段木上，一個月後白色菌絲會轉成紅色形成所謂菌膜，六個月後就可產生多孔狀的子實體。這種技術最大的優點是菌種製備時間短、接種量大，若段木處理得當，出菇的面積將很大，甚至整塊木頭都可以長出牛樟芝菌絲，非常適合大規模栽培（如圖二十三）。由於使用液態菌種含有營養豐富的醱酵液，除了讓牛樟芝菌絲成長外，也很容易引起雜菌的滋長導致接種失敗。利用液態菌種植菌技術需要充分掌握無菌操作的要領，無論菌種製備、段木處理、接種程序、植菌環境，及培植環境都必須盡量維持潔淨狀態，以降低污染率。除此之外，大面積的菌膜雖然看起來很可觀，但由於生長點過於分散，導致養份供應不足，反而有礙子實體的成長。因此一般必須將若干比率的菌膜去除，這個過程和食用菇出菇後會去除一些菇蕾以保證獲得比較大的菇體的道理是一樣的。液態菌絲接種技術是目前最被看好的植菌技術，目前在台灣無論是食用菇或藥用菇採用此方法接菌的菇場還很少，未來在技術上若能更精進，此種植菌技術應該會成為主流。